本書是面向高等醫(yī)藥院校開展信息處理與分析教學(xué)活動(dòng)設(shè)計(jì)的教材。本書以培養(yǎng)學(xué)生的信息獲取能力,分析與利用能力為目標(biāo),全面闡述了醫(yī)藥科研活動(dòng)中所運(yùn)用到的信息科學(xué)基本方法、技術(shù),工具。全書共5章,主要包括信息處理與分析的內(nèi)涵及相關(guān)技術(shù),醫(yī)藥信息處理與分析的基本流程,醫(yī)藥信息分析質(zhì)量保證的幾個(gè)關(guān)鍵因素,醫(yī)藥信息采集與預(yù)處理,醫(yī)藥信息分析方法和工具,醫(yī)藥信息處理與分析案例,醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)。
(1)注重領(lǐng)域特色、組織結(jié)構(gòu)合理
該書以醫(yī)藥信息為主線來(lái)組織素材,將信息處理技術(shù)與信息分析方法有機(jī)融合。全書采用總分式結(jié)構(gòu)進(jìn)行闡述:緒論中呈現(xiàn)了信息處理與分析的基本流程,使讀者從宏觀了解信息處理與分析每一步驟,進(jìn)而激發(fā)讀者深入學(xué)習(xí)的興趣,以掌握信息處理與分析的每一階段的關(guān)鍵技術(shù)與方法;緊緊圍繞緒論,其它章節(jié)從內(nèi)容上將信息處理與分析的每一環(huán)節(jié)有序貫通,使讀者在學(xué)習(xí)時(shí)對(duì)各章節(jié)的內(nèi)容一目了然,并能有的放矢,達(dá)到事半功倍的學(xué)習(xí)效果。
(2)選材經(jīng)典、注重理論與實(shí)踐的結(jié)合
本書的素材來(lái)自多年的教學(xué)積淀,選取了經(jīng)典、有代表性的信息處理與分析的技術(shù)、工具與方法,列舉了大量的醫(yī)藥信息處理案例分析,同時(shí)每章還配有難度適當(dāng)?shù)木毩?xí),使得理論知識(shí)與實(shí)踐操作有機(jī)結(jié)合在一起,做到正真意義上的學(xué)以致用。
(3)引導(dǎo)思維、促進(jìn)學(xué)科交叉
通過(guò)介紹醫(yī)藥信息處理技術(shù)以及信息分析方法和工具,使學(xué)生能夠從信息科學(xué)的角度對(duì)醫(yī)藥科學(xué)研究工作中的問(wèn)題進(jìn)行思考與分析,以解決跨學(xué)科間交流、合作帶來(lái)的鴻溝,從而促進(jìn)多學(xué)科交叉合作的協(xié)同研究。
晏峻峰,湖南中醫(yī)藥大學(xué)博士、教授,長(zhǎng)期從事中醫(yī)藥信息技術(shù)處理與分析的教學(xué)與科研工作,具有豐富的教學(xué)與實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),主編了多本信息技術(shù)教材。
第1章 緒論 1
1.1 信息的概念及相關(guān)知識(shí) 1
1.1.1 信息的概念 1
1.1.2 信息的基本特征 2
1.1.3 信息、數(shù)據(jù)與知識(shí)的關(guān)系 3
1.2 信息處理與分析的內(nèi)涵及相關(guān)技術(shù) 4
1.2.1 信息處理的內(nèi)涵 4
1.2.2 信息分析的內(nèi)涵 5
1.2.3 信息論及相關(guān)常識(shí) 5
1.3 醫(yī)藥信息與醫(yī)藥信息學(xué) 7
1.3.1 醫(yī)藥信息 7
1.3.2 醫(yī)藥信息學(xué) 9
1.4 醫(yī)藥信息處理與分析的基本流程 9
1.5 醫(yī)藥信息分析質(zhì)量保證的幾個(gè)關(guān)鍵因素 10
本章小結(jié) 12
本章習(xí)題 12
本章參考文獻(xiàn) 12
第2章 醫(yī)藥信息采集與預(yù)處理 13
2.1 醫(yī)藥信息資源的獲取與處理 13
2.1.1 文獻(xiàn)信息資源的獲取與處理 13
2.1.2 臨床信息資源的獲取與處理 40
2.1.3 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)資源的獲取與處理 44
2.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理的基本方法 45
2.2.1 數(shù)據(jù)清理 45
2.2.2 數(shù)據(jù)集成 46
2.2.3 數(shù)據(jù)變換 46
2.2.4 數(shù)據(jù)規(guī)約 47
2.3 醫(yī)藥信息管理及相關(guān)技術(shù) 47
2.3.1 文獻(xiàn)信息管理 48
2.3.2 數(shù)據(jù)管理 61
本章小結(jié) 62
本章習(xí)題 63
本章參考文獻(xiàn) 63
第3章 醫(yī)藥信息分析方法和工具 64
3.1 醫(yī)藥信息分析方法 64
3.1.1 醫(yī)藥信息分析的目的 65
3.1.2 醫(yī)藥信息分析內(nèi)容的分類 65
3.1.3 醫(yī)藥信息分析方法的分類 65
3.1.4 構(gòu)建分析體系的原則 66
3.2 常用信息分析工具 67
3.2.1 SAS統(tǒng)計(jì)軟件 67
3.2.2 SPSS統(tǒng)計(jì)軟件 67
3.2.3 MATLAB 68
3.2.4 R語(yǔ)言 68
3.2.5 Excel 68
3.3 MATLAB工具 69
3.3.1 MATLAB簡(jiǎn)介 69
3.3.2 MATLAB的編程基礎(chǔ) 78
3.3.3 MATLAB的矩陣運(yùn)算 82
3.3.4 MATLAB程序設(shè)計(jì) 90
3.3.5 MATLAB繪圖基礎(chǔ) 96
本章小結(jié) 107
本章附錄 常用MATLAB函數(shù)的使用方法 108
本章習(xí)題 115
本章參考文獻(xiàn) 116
第4章 醫(yī)藥信息處理與分析案例 118
4.1 多元線性回歸分析 118
4.1.1 多元線性回歸分析的基本思想 118
4.1.2 多元線性回歸分析的求解過(guò)程 119
4.1.3 多元線性回歸分析實(shí)例解析 120
4.2 主成分分析 122
4.2.1 主成分分析的基本思想 123
4.2.2 主成分分析的求解過(guò)程 123
4.2.3 主成分分析實(shí)例解析 126
4.3 聚類分析 128
4.3.1 聚類分析的基本思想 128
4.3.2 系統(tǒng)聚類 129
4.3.3 K-means聚類 133
4.4 判別分析 138
4.4.1 判別分析的基本思想 138
4.4.2 判別分析的求解過(guò)程 139
4.4.3 判別分析實(shí)例解析 140
4.5 決策樹分析 141
4.5.1 決策樹的基本概念 142
4.5.2 相關(guān)算法 143
4.5.3 決策樹的修剪 145
4.5.4 決策樹在醫(yī)院患者分析中的應(yīng)用 147
4.6 支持向量機(jī)算法 150
4.6.1 基本思想 150
4.6.2 線性SVM的求解過(guò)程 153
4.6.3 其他類型的支持向量機(jī) 154
4.6.4 MATLAB的SVM函數(shù)使用 154
4.6.5 支持向量機(jī)算法實(shí)例解析 154
4.7 貝葉斯分類算法 155
4.7.1 基本思想 156
4.7.2 求解過(guò)程 157
4.7.3 實(shí)例解析 158
4.8 時(shí)間序列分析 159
4.8.1 原理 159
4.8.2 時(shí)間序列分析的實(shí)例分析 160
4.8.3 確定性時(shí)間序列分析案例 160
本章小結(jié) 165
本章函數(shù)詳細(xì)說(shuō)明 166
本章習(xí)題 173
本章參考文獻(xiàn) 176
第5章 醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn) 177
5.1 常用醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)介紹 177
5.1.1 標(biāo)準(zhǔn)的概念 177
5.1.2 標(biāo)準(zhǔn)化的概念 180
5.1.3 標(biāo)準(zhǔn)與標(biāo)準(zhǔn)化的關(guān)系 181
5.1.4 信息標(biāo)準(zhǔn)化 182
5.1.5 國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化機(jī)構(gòu)和組織 182
5.1.6 醫(yī)學(xué)信息標(biāo)準(zhǔn) 183
5.1.7 醫(yī)學(xué)信息交換標(biāo)準(zhǔn) 184
5.2 醫(yī)學(xué)信息分類與編碼 186
5.2.1 分類 186
5.2.2 編碼 187
5.2.3 醫(yī)學(xué)信息分類與編碼的方法 187
5.3 醫(yī)藥信息處理與分析中應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)的原則 188
本章小結(jié) 188
本章習(xí)題 188
本章參考文獻(xiàn) 189