本書由16所985、211高校聯合編寫而成，系統全面地介紹了生物信息學的基本概念與內容。全書共12章，內容涵蓋分子生物學數據庫、DNA/氨基酸序列比對、基因結構與功能、蛋白質結構與功能、系統生物學、合成生物學、計算生物學等生物信息學中的重點問題。第一章回顧了生物信息學歷史，第二章介紹了分子生物學相關信息資源，第三章至第六章敘述了從序列比對分析到蛋白質結構預測再到基因組學、蛋白質組學的研究，第七章和第八章介紹了系統生物學與合成生物學的研究內容及成果，第九章介紹了分子進化分析方法，第十章討論了統計學習與推理等基本知識，第十一章討論了生物信息學基本的編程基礎，第十二章敘述了第二代測序技術的基本概念與分析應用。
本書可用作高等院校生物信息學專業的教材，也可作為科研院所相關專業學生、研究人員的參考用書。
彩版
序
前言
第一章 生物信息學的概念及其發展歷史
第一節 生物信息學的發展歷史
第二節 生物信息學的研究領域
第三節 生物信息學的主要應用
第四節 生物信息學面臨的挑戰
思考題
參考文獻
第二章 生物學數據庫及其檢索
第一節 生物學數據庫簡介
第二節 生物學數據庫的內容與結構
第三節 生物學數據庫的檢索
思考題
參考文獻
第三章 序列比對原理
第一節 序列比對相關概念
第二節 序列比對打分方法
第三節 序列比對算法
第四節 序列比對工具
第五節 多序列比對
思考題
參考文獻
第四章 蛋白質結構分析
第一節 蛋白質結構組織層次
第二節 蛋白質結構的測定與理論預測
第三節 蛋白質折疊與疾病
思考題
參考文獻
第五章 真核生物基因組的注釋
第一節 蛋白質編碼基因的注釋
第二節 RNA基因的注釋
第三節 重復序列的注釋
第四節 假基因的注釋
第五節 案例分析:黃瓜基因組的注釋
思考題
參考文獻
第六章 蛋白質組學
第一節 蛋白質組學概述
第二節 蛋白質的大規模分離鑒定技術
第三節 蛋白質的翻譯后修飾
第四節 蛋白質分選
第五節 蛋白質相互作用
思考題
參考文獻
第七章 系統生物學
第一節 系統生物學基本概念
第二節 系統生物學基本技術與方法
第三節 先進的成像技術
第四節 基因表達調控網絡
第五節 代謝網絡
第六節 信號轉導途徑
第七節 蛋白質蛋白質相互作用網絡
第八節 虛擬細胞
思考題
參考文獻
第八章 合成生物學
第一節 合成生物學概述
第二節 合成生物學基礎研究經典實例
第三節 合成生物學應用研究經典實例
思考題
參考文獻
第九章 分子進化與系統發育
第一節 分子進化與系統發育
第二節 分子系統發育樹的構建方法
第三節 系統發育樹構建及應用
思考題
參考文獻
第十章 統計學習與推理
第一節 統計學習與推理基礎
第二節 統計模型與參數推斷
第三節 聚類分析、主成分分析與Fisher判別
第四節 貝葉斯推理
第五節 隱馬爾可夫模型
第六節 動態神經網絡
第七節 支持向量機
第八節 MATLAB的應用實例
思考題
參考文獻
第十一章 生物信息學編程基礎
第一節 Linux操作系統
第二節 生物信息學中的編程語言
第三節 SQL及數據庫編程
第四節 并行計算
思考題
參考文獻
第十二章 第二代測序技術及其應用
第一節 測序技術概述
第二節 第二代測序原理
第三節 第二代測序技術的應用
第四節 生物信息學在第二代測序中的應用
思考題
參考文獻
作者介紹
陳銘、何華勤、徐程
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