分子生物學(xué)是生命科學(xué)發(fā)展過程中誕生的一門實(shí)驗(yàn)性極強(qiáng)的新興學(xué)科。美國著名分子生物學(xué)家Robert F.Weaver遵循這一學(xué)科發(fā)展的特點(diǎn),于1999年出版了Molecular Biology一書。《分子生物學(xué)(第五版)》以原始研究論文為基礎(chǔ),通過對實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)、對結(jié)果的分析而逐步展開對分子生物學(xué)理論的講述,文字通俗流暢,敘述由淺入深。隨著學(xué)科的迅速發(fā)展,幾經(jīng)修訂再版的《分子生物學(xué)》第五版共有導(dǎo)論,分子生物學(xué)方法,原核生物的轉(zhuǎn)錄,真核生物的轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄后加工,翻譯,DNA復(fù)制、重組和轉(zhuǎn)座,以及基因組等8個(gè)部分共25章的內(nèi)容,書后還附有術(shù)語表。每一章節(jié)都以提出科學(xué)問題、展開研究過程開始,以提供思考習(xí)題、推薦閱讀文獻(xiàn)結(jié)束。
Robert F. Weaver的《分子生物學(xué)》一書歷經(jīng)十余年,已更新到第五版。最新版本秉承了本書的優(yōu)良傳統(tǒng),特色鮮明、內(nèi)容詳盡,圖文并茂,易讀易記。最突出的特點(diǎn)是本書極富邏輯性,編寫人性化,每個(gè)結(jié)論都由具體實(shí)驗(yàn)得出,這不但讓讀者記住了實(shí)驗(yàn)方法,更可以感受到分子生物學(xué)的精妙與美。此中文版排版清晰、美觀,并贈送包含原版彩圖的光盤。《分子生物學(xué)》第五版將是分子生物學(xué)領(lǐng)域最好的參考書。
Rob Weaver出生于美國堪薩斯州的首府托皮卡市,在弗吉尼亞州的阿靈頓地區(qū)長大。1964年在俄亥俄州的烏斯勒學(xué)院獲得化學(xué)學(xué)士學(xué)位。1969年在杜克大學(xué)獲得生物化學(xué)專業(yè)博士學(xué)位,此后他在加州大學(xué)舊金山分校從事了兩年的博士后研究工作,師從WillamJ.Rutter教授研究真核生物RNA聚合酶的結(jié)構(gòu)。
1971年他受聘于堪薩斯大學(xué),任生物化學(xué)助理教授,后晉升為副教授,并于1981年任教授。自1984年以來,Rob Weaver一直擔(dān)任生物化學(xué)系的系主任,1995年開始擔(dān)任文理學(xué)院副院長。
文理學(xué)院管轄14個(gè)不同的系和研究中心,Weaver教授分管科學(xué)和數(shù)學(xué)系。作為一位分子生物學(xué)教授,他主講分子生物學(xué)概論和癌癥分子生物學(xué)兩門課程,并指導(dǎo)本科生和研究生在實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行感染鱗翅目幼蟲的桿狀病毒分子生物學(xué)方面的研究工作。
Weaver教授的研究受到美國國立衛(wèi)生研究所、美國國家科學(xué)基金和美國癌癥協(xié)會的資助,發(fā)表了多篇科學(xué)論文。并且他還與同事一道合著了兩本遺傳學(xué)教科書,為《美國國家地理雜志》撰寫過兩篇分子生物學(xué)方面的文章。作為美國癌癥協(xié)會的研究人員,他在歐洲的兩個(gè)實(shí)驗(yàn)室(瑞士的蘇黎世和英國的牛津大學(xué))分別進(jìn)行了一年的訪問研究。
第Ⅰ部分 導(dǎo)論
1 分子生物學(xué)簡史
2 基因的分子特性
3 基因功能簡介
第Ⅱ部分 分子生物學(xué)方法
4 分子克隆方法
5 研究基因及基因活性的分子工具
第Ⅲ部分 原核生物的轉(zhuǎn)錄
6 細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄機(jī)制
7 操縱子:細(xì)菌轉(zhuǎn)錄的精細(xì)調(diào)控
8 細(xì)菌轉(zhuǎn)錄機(jī)制的主要轉(zhuǎn)換模式
9 細(xì)菌中DNA-蛋白質(zhì)的相互作用
第Ⅰ部分 導(dǎo)論
1 分子生物學(xué)簡史
2 基因的分子特性
3 基因功能簡介
第Ⅱ部分 分子生物學(xué)方法
4 分子克隆方法
5 研究基因及基因活性的分子工具
第Ⅲ部分 原核生物的轉(zhuǎn)錄
6 細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄機(jī)制
7 操縱子:細(xì)菌轉(zhuǎn)錄的精細(xì)調(diào)控
8 細(xì)菌轉(zhuǎn)錄機(jī)制的主要轉(zhuǎn)換模式
9 細(xì)菌中DNA-蛋白質(zhì)的相互作用
第Ⅳ部分 真核生物的轉(zhuǎn)錄
10 真核生物的RNA聚合酶及其啟動子
11 真核生物中的通用轉(zhuǎn)錄因子
12 真核生物的轉(zhuǎn)錄激活因子
13 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及其對基因轉(zhuǎn)錄的影響
第Ⅴ部分 轉(zhuǎn)錄后加工
14 RNA加工Ⅰ:剪接
15 RNA加工Ⅱ:加帽和多腺苷酸化
16 其他RNA加工事件及基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控
第Ⅵ部分 翻譯
17 翻譯機(jī)制Ⅰ:起始
18 翻譯機(jī)制Ⅱ:延伸與終止
19 核糖體和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA
第Ⅶ部分 DNA復(fù)制、重組和轉(zhuǎn)座
20 DNA復(fù)制、損傷與修復(fù)
21 DNA復(fù)制Ⅱ:詳細(xì)機(jī)制
22 同源重組
23 轉(zhuǎn)座
第Ⅷ部分 基因組
24 基因組學(xué)Ⅰ:全基因組測序
25 基因組學(xué)Ⅱ:功能基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)目 錄
譯者序
序言
致謝
分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)目錄
第Ⅰ部分 導(dǎo) 論
第1章 分子生物學(xué)簡史
1.1 傳遞遺傳學(xué)
孟德爾的遺傳定律
遺傳的染色體理論
遺傳重組和遺傳定位
重組的物理學(xué)證據(jù)
1.2 分子遺傳學(xué)
DNA的發(fā)現(xiàn)
基因和蛋白質(zhì)之間的關(guān)系
基因的行為
1.3 生命的三個(gè)域
第2章 基因的分子特性
2.1 遺傳物質(zhì)的特性
細(xì)菌轉(zhuǎn)化
多核苷酸的化學(xué)本質(zhì)
2.2 DNA結(jié)構(gòu)
實(shí)驗(yàn)背景
雙螺旋
2.3 RNA基因
2.4 核酸的物理化學(xué)性質(zhì)
DNA結(jié)構(gòu)的多樣性
不同大小和形狀的DNA
第3章 基因功能簡介
3.1 儲存信息
基因表達(dá)的總體過程
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
蛋白質(zhì)功能
信使RNA的發(fā)現(xiàn)
轉(zhuǎn)錄
翻譯
3.2 復(fù)制
3.3 突變
鐮狀細(xì)胞貧血病
第Ⅱ部分 分子生物學(xué)方法
第4章 分子克隆方法
4.1 基因克隆
限制性內(nèi)切核酸酶的作用
載體
用特異性探針鑒定目的克隆
cDNA克隆
cDNA末端快速擴(kuò)增
4.2 聚合酶鏈反應(yīng)
標(biāo)準(zhǔn)PCR
用反轉(zhuǎn)錄酶PCR進(jìn)行cDNA克隆
實(shí)時(shí)定量PCR
4.3 表達(dá)克隆基因的方法
表達(dá)載體
其他真核載體
利用Ti質(zhì)粒將基因?qū)胫参?br> 第5章 研究基因和基因活性的分子工具
5.1 分子的分離
凝膠電泳
雙向凝膠電泳
離子交換層析
凝膠過濾層析
親和層析
5.2 示蹤標(biāo)記
放射自顯影
磷屏成像
液體閃爍計(jì)數(shù)器
非放射性示蹤
5.3 核酸雜交的應(yīng)用
Southern 印跡:鑒定特異DNA片段
DNA指紋和DNA分型
DNA指紋和DNA分型在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用
原位雜交:基因在染色體中的定位
免疫印跡(Western 印跡)
5.4 DNA測序和物理圖
Sanger鏈末端終止測序法
自動化DNA測序
高通量測序
限制圖
5.5 基于克隆基因的蛋白質(zhì)工程:定點(diǎn)誘變
5.6 圖譜定位與轉(zhuǎn)錄物定量
Northern印跡
S1核酸酶作圖
引物延伸法
截?cái)噢D(zhuǎn)錄和無G盒轉(zhuǎn)錄
5.7 測定體內(nèi)轉(zhuǎn)錄速率
細(xì)胞核連綴轉(zhuǎn)錄
報(bào)告基因轉(zhuǎn)錄
測定體內(nèi)蛋白質(zhì)積累
5.8 分析DNA-蛋白質(zhì)相互作用
濾膜結(jié)合
凝膠阻滯
DNA酶足跡
DMS足跡法和其他足跡法
染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)
5.9 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用研究
5.10 尋找與其他分子相互作用的RNA序列
SELEX
功能SELEX
5.11 基因敲除和轉(zhuǎn)基因
基因敲除小鼠
轉(zhuǎn)基因小鼠
第Ⅲ部分 原核生物的轉(zhuǎn)錄
第6章 細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄機(jī)制
6.1 RNA聚合酶的結(jié)構(gòu)
σ亞基是一種特異性因子
6.2 啟動子
RNA聚合酶與啟動子的結(jié)合
啟動子結(jié)構(gòu)
6.3 轉(zhuǎn)錄起始
σ因子促進(jìn)轉(zhuǎn)錄起始
σ因子的再利用
σ循環(huán)的隨機(jī)模型
啟動子處DNA的局部解鏈
啟動子清除
σ因子的結(jié)構(gòu)和功能
α亞基在UP元件識別中的功能
6.4 延伸
核心酶在延伸過程中的作用
延伸復(fù)合體的結(jié)構(gòu)
6.5 轉(zhuǎn)錄的終止
Rho非依賴型終止
Rho依賴型終止
第7章 操縱子:細(xì)菌轉(zhuǎn)錄的精細(xì)調(diào)控
7.1 lac操縱子
lac操縱子的負(fù)調(diào)控
操縱子的發(fā)現(xiàn)
阻遏物與操縱基因間的相互作用
阻遏機(jī)制
lac操縱子的正調(diào)控
CAP的作用機(jī)制
7.2 ara操縱子
ara操縱子的阻遏環(huán)
ara操縱子阻遏環(huán)的證據(jù)
araC的自主調(diào)節(jié)
7.3 trp操縱子
色氨酸在trp操縱子負(fù)調(diào)控中的作用
衰減作用對trp操縱子的調(diào)控
衰減作用的失效
7.4 核糖開關(guān)
第8章 細(xì)菌轉(zhuǎn)錄機(jī)制的主要轉(zhuǎn)換模式
8.1 σ因子的轉(zhuǎn)換
噬菌體感染
孢子形成
擁有多啟動子的基因
其他σ因子的轉(zhuǎn)換
抗σ因子
8.2 T7噬菌體所編碼的RNA聚合酶
8.3 λ噬菌體對E.coli的感染
λ噬菌體的裂解繁殖
溶源態(tài)的建立
溶源期cI基因的自我調(diào)節(jié)
被λ噬菌體感染后寄主命運(yùn)的決定:裂解或溶源溶源菌的誘導(dǎo)
第9章 細(xì)菌中DNA蛋白質(zhì)的相互作用
9.1 λ阻遏物家族
利用定點(diǎn)突變探測結(jié)合的專一性
λ阻遏物-操縱基因相互作用的高分辨率分析
434噬菌體阻遏物-操縱基因相互作用的高分辨率分析
9.2 trp阻遏物
色氨酸的作用
9.3 對蛋白質(zhì)-DNA相互作用的一般性認(rèn)識
四個(gè)不同堿基對的氫鍵形成能力
多聚DNA結(jié)合蛋白的重要性
9.4 DNA結(jié)合蛋白:遠(yuǎn)程作用Gal操縱子
重復(fù)的λ操縱基因
增強(qiáng)子
第Ⅳ部分 真核生物的轉(zhuǎn)錄
第10章 真核生物的RNA聚合酶及其啟動子
10.1 真核生物RNA聚合酶的多種形式
三類細(xì)胞核聚合酶的分離
三類RNA聚合酶的作用
RNA聚合酶亞基結(jié)構(gòu)
10.2 啟動子
Ⅱ類啟動子
Ⅰ類啟動子
Ⅲ類啟動子
10.3 增強(qiáng)子與沉默子
增強(qiáng)子
沉默子
第11章 真核生物中的通用轉(zhuǎn)錄因子
11.1 Ⅱ類因子
Ⅱ類預(yù)起始復(fù)合物
TFIID的結(jié)構(gòu)和功能
TFIIB的結(jié)構(gòu)和功能
TFIIH的結(jié)構(gòu)和功能
中介物復(fù)合體和RNA聚合酶Ⅱ全酶
延伸因子
11.2 Ⅰ類因子
核心結(jié)合因子
UPE結(jié)合因子
SL1的結(jié)構(gòu)和功能
11.3 Ⅲ類因子
TFIIIA
TFIIIB和TFIIIC
TBP的作用
第12章 真核生物的轉(zhuǎn)錄激活因子
12.1 激活因子的類型
DNA結(jié)合域
轉(zhuǎn)錄激活域
12.2 激活因子DNA結(jié)合模體的結(jié)構(gòu)
鋅指結(jié)構(gòu)
GAL4蛋白
細(xì)胞核受體
同源異型域
亮氨酸拉鏈和螺旋-環(huán)-螺旋域
12.3 激活因子各功能域的獨(dú)立性
12.4 激活因子的功能
TFIID的募集作用
聚合酶全酶的募集
12.5 激活因子間的相互作用
二聚化作用
遠(yuǎn)程作用
轉(zhuǎn)錄工廠
復(fù)合增強(qiáng)子
結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄因子
增強(qiáng)體
絕緣子
12.6 轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控
輔激活因子
激活因子的泛素化
激活因子的SUMO修飾
激活因子的乙酰化
信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
第13章 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及其對基因轉(zhuǎn)錄的影響
13.1 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)
組蛋白
核小體
30nm纖絲
染色質(zhì)折疊的更高級結(jié)構(gòu)
13.2 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與基因活性
組蛋白對Ⅱ類基因轉(zhuǎn)錄的影響
核小體定位
組蛋白乙;
組蛋白去乙;
染色質(zhì)重建
異染色質(zhì)與沉默
核小體與轉(zhuǎn)錄的延伸
第Ⅴ部分 轉(zhuǎn)錄后加工
第14章 RNA加工Ⅰ:剪接
14.1 斷裂基因
有關(guān)斷裂基因的證據(jù)
RNA剪接
剪接信號
剪接對基因表達(dá)的影響
14.2 細(xì)胞核前體mRNA的剪接機(jī)制
分支中間體
分支點(diǎn)信號
剪接體
剪接體的組裝及功能
定向、剪接位點(diǎn)的選擇及選擇性剪接
剪接的調(diào)控
14.3 RNA的自剪接
Ⅰ型內(nèi)含子
Ⅱ型內(nèi)含子
第15章 RNA加工Ⅱ:加帽和多腺苷酸化
15.1 加帽
帽的結(jié)構(gòu)
帽的合成
帽的功能
15.2 多腺苷酸化
poly(A)
poly(A)的功能
多腺苷酸化的基本機(jī)制
多腺苷酸化信號
前體mRNA的剪切和多腺苷酸化
poly(A)聚合酶
poly(A)的更新
15.3 mRNA加工事件的協(xié)同運(yùn)作
Rpb1的CTD與mRNA加工蛋白的結(jié)合
RNA加工蛋白與CTD結(jié)合的變化與CTD磷酸化相關(guān)
存在一個(gè)CTD密碼?
轉(zhuǎn)錄終止與mRNA 3'端加工的偶聯(lián)
終止的機(jī)制
多腺苷酸尾在mRNA轉(zhuǎn)運(yùn)中的作用
第16章 其他RNA加工事件及基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控
16.1 核糖體RNA的加工
真核生物rRNA的加工
細(xì)菌rRNA的加工
16.2 轉(zhuǎn)運(yùn)RNA的加工
切開多順反子前體物
成熟5′端的形成
成熟3′端的形成
16.3 反式剪接
反式剪接機(jī)制
16.4 RNA編輯
編輯的機(jī)制
核苷酸去氨基化編輯
16.5 基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控:mRNA穩(wěn)定性
酪蛋白mRNA的穩(wěn)定性
轉(zhuǎn)鐵蛋白受體mRNA的穩(wěn)定性
16.6 基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控:RNA干擾
RNAi的機(jī)制
siRNA的擴(kuò)增
RNAi機(jī)制在異染色質(zhì)形成和芳同論的中的作用
16.7 Piwi互作RNA與轉(zhuǎn)座子調(diào)控
16.8 基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控:microRNA
miRNA引起的翻譯沉默
miRNA引起的翻譯激活
16.9 翻譯的抑制、mRNA降解及P-體
P-體(加工體)
P-體中的mRNA降解
P-體中的抑制解除
其他小RNA
第Ⅵ部分 翻譯
第17章 翻譯機(jī)制Ⅰ:起始
17.1 細(xì)菌中翻譯的起始
tRNA負(fù)載
核糖體的解離
30S起始復(fù)合物的形成
70S起始復(fù)合物的形成
細(xì)菌中的翻譯起始總結(jié)
17.2 真核生物翻譯的起始
起始的掃描模型
真核生物的起始因子
17.3 翻譯起始的調(diào)控
細(xì)菌的翻譯調(diào)控
真核生物的翻譯調(diào)控
第18章 翻譯機(jī)制Ⅱ:延伸與終止
18.1 多肽鏈合成及mRNA翻譯的方向
18.2 遺傳密碼子
非重疊性密碼子
密碼中無間隔
三聯(lián)密碼
破譯密碼
密碼子與反密碼子間的異常堿基配對
(幾乎)通用的密碼
18.3 延伸機(jī)制
延伸概述
核糖體的3-位點(diǎn)模型
延伸步驟2:肽鍵的形成
延伸步驟3:移位
G蛋白和翻譯
EF-Tu和EF-G的結(jié)構(gòu)
18.4 終止
終止密碼子
終止密碼子的抑制
釋放因子
異常終止的處理
18.5 翻譯后
新生蛋白質(zhì)的折疊
核糖體從mRNA的釋放
第19章 核糖體和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA
19.1 核糖體
70S核糖體的精細(xì)結(jié)構(gòu)
核糖體的組成
30S亞基的精細(xì)結(jié)構(gòu)
50S亞基的精細(xì)結(jié)構(gòu)
核糖體結(jié)構(gòu)與翻譯的機(jī)制
多聚核糖體
19.2 轉(zhuǎn)運(yùn)RNA
tRNA的發(fā)現(xiàn)
tRNA的結(jié)構(gòu)
第Ⅶ部分 DNA復(fù)制、重組和轉(zhuǎn)座
第20章 DNA復(fù)制、損傷與修復(fù)
20.1 DNA復(fù)制的一般特征
半保留復(fù)制
至少是半不連續(xù)復(fù)制
DNA合成的引發(fā)
雙向復(fù)制
滾環(huán)復(fù)制
20.2 DNA復(fù)制的酶學(xué)
E.coli的三種DNA聚合酶
復(fù)制的忠實(shí)性
真核生物的多種DNA聚合酶
鏈的解離
單鏈DNA結(jié)合蛋白
拓?fù)洚悩?gòu)酶
20.3 DNA損傷與修復(fù)
紫外線輻射引起的DNA損傷
γ射線及X射線引起的DNA損傷直接消除DNA損傷
切除修復(fù)
真核生物的雙鏈斷裂修復(fù)
錯(cuò)配修復(fù)
人類細(xì)胞錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)的失效
DNA損傷的非修復(fù)處理
第21章 DNA復(fù)制Ⅱ:詳細(xì)機(jī)制
21.1 復(fù)制的起始
E.coli的DNA復(fù)制引發(fā)
真核生物DNA復(fù)制的引發(fā)
21.2 延伸
復(fù)制的速度
Pol Ⅲ全酶與復(fù)制的持續(xù)性
21.3 復(fù)制的終止
解連環(huán):解開子代DNA
真核生物DNA復(fù)制的終止
第22章 同源重組
22.1 同源重組的RecBCD途徑
22.2 RecBCD途徑的實(shí)驗(yàn)證據(jù)
RecA
RecBCD
RuvA和RuvB
RuvC
22.3 減數(shù)分裂重組
減數(shù)分裂重組的機(jī)制:綜述
雙鏈DNA斷裂
DSB處單鏈末端的生成
22.4 基因轉(zhuǎn)換
第23章 轉(zhuǎn)座
23.1 細(xì)菌轉(zhuǎn)座子
細(xì)菌轉(zhuǎn)座子的發(fā)現(xiàn)
插入序列:最簡單的細(xì)菌轉(zhuǎn)座子
更復(fù)雜的轉(zhuǎn)座子
轉(zhuǎn)座的機(jī)制
23.2 真核生物的轉(zhuǎn)座子
P元件
23.3 免疫球蛋白基因的重排
重組信號
重組酶
V(D)J重組機(jī)制
23.4 反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子
反轉(zhuǎn)錄病毒
反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子
第Ⅷ部分 基因組
第24章 基因組學(xué)Ⅰ:全基因組測序
24.1 圖位克。夯蚪M學(xué)介紹
圖位克隆的傳統(tǒng)手段
鑒定與人類疾病相關(guān)的突變基因
24.2 基因組測序技術(shù)
人類基因組計(jì)劃
用于大規(guī);蚪M計(jì)劃的載體
逐步克隆策略
鳥槍法測序
測序的標(biāo)準(zhǔn)
24.3 基因組測序的研究和比較
人類基因組測序
個(gè)體基因組學(xué)
其他脊椎動物基因組
最小的基因組
生命條形碼
第25章 基因組學(xué)Ⅱ:功能基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)
25.1 功能基因組學(xué):基因組的基因表達(dá)
轉(zhuǎn)錄組學(xué)
基因組功能圖表
單核苷酸多態(tài)性:藥物基因組學(xué)
25.2 蛋白質(zhì)組學(xué)
蛋白質(zhì)分離
蛋白質(zhì)分析
定量蛋白質(zhì)組學(xué)
蛋白質(zhì)的相互作用
25.3 生物信息學(xué)
從哺乳動物基因組中發(fā)現(xiàn)調(diào)控基序
學(xué)會使用數(shù)據(jù)庫
分子生物學(xué)專業(yè)詞匯表
索引
教師反饋表